检测的准确性高，对未知突变大于96%，已知突变大于99%。检测灵敏度高，能检测低水平的突变，可靠检测样品中少至5%的基因型。可分析异质性样本，可进行混合样品的分离检测。操作容易，自动化分析。结果重复性高，速度快。样品通量高。消耗品低价性，性价比高。^[1]

具有高通量检测、自动化程度高、灵敏度和特异性较高、检测DNA片段和长度变动范围广、相对价廉等优点。与传统的SSCP 、DGGE等方法相比，DHPLC有较多的优点。SSCP的结果受血样质量、提取方法等因素的影响，并且需要跑胶、电泳；DGGE则需要标记引物，存在放射性污染，这两种方法都比较费时费力。而DHPLC则高度自动化，可以自动取样，检测每个样品只需要8分钟左右。^[1]