气相色谱仪NPD需要进行定期清洗。在大多数情况下，只包括清洗收集极和喷嘴。一般气相色谱仪都配有刷子和金属丝。刷子用于清扫喷嘴口的颗粒物。不要迫使太粗的金属丝或探针进入喷嘴口，否则喷嘴口将被破坏若喷嘴变形，将会导致灵敏度下降或峰形变差。用刷子清洁之后，可以用超声波清洗各个部件。终将需要更换喷嘴，因此，强烈推荐在手头有备用的喷嘴。
经过一段时间的使用，来自于铷珠或样品的残留物将会积聚在收集极上，并导致基线问题。在更换铷珠2-3次后，应该清洗检测器。
每次拆装均会造成金属垫片等的磨损。几次拆装之后（5次或更多次），密封环就可能无效导致基线不稳。更换检测器不见时一定要将检测器温度降低到室温。因为NPD没有任何火焰，其喷嘴不像FID喷嘴那样收集二氧化硅和燃烧烟尘。虽然可以清洗喷嘴，但是简单的用新喷嘴取代脏喷嘴往往更加实用。清洗喷嘴记得用金属丝，并且是清洁的，小心操作，千万不要损坏喷嘴的内部，也可以使用超声波清洗喷嘴。
NPD是在FID基础上发展起来的，它与FID的不同在于增加了一个热离子源（由铷盐珠构成），其用微氢焰。在热离子源通电加热的条件下，含氮和含磷化合物的离子化效率大为进步，故可选择性地检测这两类化合物。由于用氢气，NPD的安全题目与FID相同。
热离子源的温度变化对检测器灵敏度的影响极大。温度高，灵敏度就高，但铷盐珠的寿命就会缩短。增加热离子源的电压，加大氢气流量，均可进步灵敏度。然而必须要留意，空气流量太底又会导致检测器的平衡时间太长；氢气流量太高，又会形成FID那样的火焰，大大降低了铷盐珠的使用寿命，而且破坏了对氮和磷的选择信性响应。气体流量一般设定为，氢气3~4ml/min，空气100~120ml/min，用填充柱和大口径柱，载气流量在20ml/min左右，不用尾吹气，用常规毛细柱时，尾吹气设定为30ml/min左右。
在调节和设置热离子源的电压时，切记封闭检测器电源，以免不小心烧毁铷盐珠。
热离子源的活性元素（铷盐）轻易被污染缩短使用寿命。要延长其使用寿命应留意；
，封闭载气（如换钢瓶或换色谱柱）前，应将热离子源的电压调为0，否则没有载气通过，铷盐珠会在几分钟内烧毁。
第二，避免SiO2进进检测器，色谱柱要很好的老化，尤其硅氧烷类固定液，其液膜要薄。还要避免衍生化后样品中有SiO2残留进进色谱柱。
第三，在满足灵敏度要求的条件下，尽可能用低的热离子源电压。
第四，仪器存放要避免湿润，当仪器不用时，一般保持检测器温度在100以上（热离子源电压要封闭）。
第五，假如一段时间不进样分析（如过夜），就应该降低热离子源电压，但不要封闭。由于减低电压后铷盐珠还是热的，再进样时升高电压很快就能稳定。假如封闭后再通电压，则检测器需要几小时的平衡时间。