生化配套纯水机水处理系统中的滞留区或死区，容易造成污染物的堆积，尤其会造成微生物污染；同时也为系统后期清洗留下隐患。水处理系统中主要的滞留区是反渗透膜元件和压力容器之间区域以及反渗透水的储存装置。

进入讨论前，我们先来了解一下微生物污染的特点。微生物主要是指细菌及其释放和降解产物—内毒素。

细菌：在水中常见细菌是革兰氏阴性菌和非结核性分支杆菌，它们特别适应水中的生存。由于这类细菌能形成电性改变的生物膜（biofilm），使它能够附着在物体的表面，很难被清除。在水处理系统中主要存在于反渗透膜与膜壳之间的滞留区、反渗水箱、送液管道等地方。同时生物膜能够保护细菌对抗消毒剂对它们杀灭。当有合适的PH值（酸性平衡），营养和温度时，它们能很快地繁殖。如果细菌进入病人的血液中，就可以引起败血症。如果细菌的产物和细胞膜的成份通过膜孔进入血液，可以引起病人的致热反应。使病人出现发抖、发热、低血压、等症状。严重可引起病人死亡。

内毒素：内毒素是细菌细胞壁的成份，当细菌分解，内毒素便被释放出来。因为内毒素能引起透析病人的发热反应，所以它们又被称为致热源。由此而引起病人的反应称热源反应。透析病人长期与含有内毒素的水接触可引发长期的并发症。内毒素的分子量很小，可以通过弥散作用通过透析膜进入血中。因为内毒素不是一种活体，不可能被杀死，也很难被清除。