目前国内国外的其对反渗透膜及供水管路的消毒多为人为操作，需要操作者对系统的消毒过程全程跟踪。对消毒时间、浸泡时间、清洗时间等都是凭操作者的经验来完成。这种消毒过程及操作方法在中是普遍存在的。

化学消毒工艺过程：

1. 根据污染类型，选择适当化学药品。
2. 在触摸屏上选择并进入消毒功能。
3. 按消毒键，按提示在消毒循环桶内加入适量化学药品。
4. 系统自动在消毒桶内加满水来稀释化学药品。
5. 在触摸屏上按下确认，系统开始消毒及清洗程序。

在这个过程中，包括:稀释（2min）， 循环（包括主机及回路）（30min） ， 浸泡（60min）， 排放清洗（20min）6次后，检测系统清洗干净程度。这期间不再需要人员职守及扳动任何阀门、开关等，而且是对RO主机及后级循环回路同时一次完成。

合适的清洗药品和正确清洗方法是清洗成功的关键

根据污染情况，合理按特定次序使用各种不同的清洗药品进行清洗，以获得*的清洗效果。比如首先使用低PH值的清洗除去水垢一类的物质，然后使用一种高PH值的清洗液除去有机物。但是有时也会首先使用高PH值的清洗液除去油类污垢，然后再使用一低PH值的清洗液。有一些清洗液中还添加有洗涤剂，这将有助于清除污染严重的生物和有机杂质。其它的清洗添加有象EDTA之类的螯合剂，这些螯合剂有助于清除胶体、有机物、生物杂质和硫酸盐垢。必须记住的是选用不正确的清洗药品或清洗步骤不正确时可能会使污堵更严重。