烘箱的温度控制采用了智能温控和PID自控系统，温度信号的采集用铂电阻，经温度控制器的放大与设定值进行比较得到PID控制信号，同时PID程控器输出控制信号控制固态继电器SSR导通，固态继电器再控制加热器加热，使箱体处于升温除湿阶段。当温度达到设定值时，温控仪输出PID，输出控制信号给时间继电器KT，使其开始保温计时，同时，关闭进风机。通过PID控制电加热不断启闭，工业烘箱处于热风循环保温灭菌阶段。当保温灭菌时间达到设定值时，时间继电器输出信号输出全闭电加热，开启水冷却电磁阀，使其吸合导通，从而箱体处于冷却降温阶段。当箱内温度下降≤40℃时，温控仪输出控制信号输出关闭热风循环风机，干燥灭菌周期程序结束。
超温报警温控仪输出信号控制整个程序的运行，铂电阻PT100测试信号至报警温控仪与超温报警设置温度值进行比较，当实际温度值低于设定值时，实际温度值超过设定值时，故超温报警的设置值一般要高于工作温度的设定值。