实验室超纯水机在选择的时候需要考虑：
1、仪器种类
可以根据使用的仪器种类来选择超纯水机。液相用水的电阻大于18兆欧；并且要去除有机物；原子吸收、原子荧光及环境监测仪器用水大于18兆欧就行；PCR等生命科学仪器用水除了电阻大于18兆欧以外，还需除菌，除有机物，除热源。
2、用水来源
如果用水是合格的，也可以将该纯水的来源方式告知实验室超纯水机厂商，其技术人员会根据该情况来推荐相应的规格型号。但是最准确的型号选择还是尽量提供详细的水质参数，如电阻、微量元素、细菌、总有机碳水平等。
3、实验室超纯水机原水水质
在选购超纯水机时一定要向厂商提供原水的水质状况，比如泥沙多，硬度高，地下水等情况，超纯水机的工艺是根据原水水质的好坏来确定的，泥沙多，要添加预处理装置，硬度高，要添加软化装置，含盐量高，要采用二级反渗透工艺等。如果选用以纯水为水源的超纯水机，则只需要提供水质需求和用水量就可以了。
4、用水：以自来水为水源的超纯水机一般都有两个出水口，分别是三级水和一级水，经反渗透出来的水是三级水，存放在水箱里，而一级水是即用即取，不存放。三级水没有通过纯化柱，一级水通过了纯化柱，一级水的成本高于三级水。所以客户在日常应用的时候，应根据水质需求分质取水，能用三级水时尽量不用一级水，避免使用成本的上升。
