洁净室中过滤器的安装密封，是确保洁净室洁净度的关键因素之一，因此，在洁净室设计时，应该选择的密封技术和可靠的密封方法。
1、接触填料密封，密封用填料有固体密封垫如：氯丁橡胶，闭孔海绵橡胶板等）和液密封胶（如：硅橡胶、氯丁橡胶、天然橡胶）。固体密封垫有一般采用螺栓母机械压紧的密封方法。橡胶板的压缩量一般为30%-50%。液体密封胶是靠填充和粘附方法密封。该密封方法是一般洁净室zui常用的密封方法。 
2、液槽刀口密封，在槽形框架中注人一定高度的非牛顿密封液体（如：氯异丁烯等），过滤器的刀口插入密封液里，使两侧的空气通路受到阻隔，达到密封目的。这种密封方法可靠性强，过滤器拆装方便，通常应用于100级、10级和更别洁净度的洁净室密封。 
3、负压泄露密封，这种密封方法的原理是正压空间泄露的污染空气，人为疏导到工作区外的负压空间，确保工作区不受污染。这种密封方法通常用于升小规格的洁净室的密封。