在完成前述的系统检查及试验后，本系统即具备了投入运行的条件。一般的投运程序及注意事项如下：
1、合上各仪表盘、UPS的电源开关，并再次确认民源电压符合设计要求。然后按工艺过程的操作要求依次打开各取压点、分析点的截止阀。
2、打开向系统内各阀门定位器供气的阀门，再次确认气源压力符合要求。
3、投运差压变送器时，先打开平衡阀，然后打开检测阀，zui后全关平衡阀。
4、按工艺确定的程序投入各种测量、控制、调节仪表及连锁报警系统。
5、仪表投运期间，若需要停止其运行或又要再投运，应与操作人员，特别是与连锁报警系统或自动调节，自动控制系统有关是仪表，以便操作人员事先准备好必要的操作对策。
6、当需要使用“连锁解除”按钮时也应与操作人员，并密切注意被解除了连锁的仪表所显示的工艺参数，应尽快恢复连锁。
7、自动调节系统的工艺参数设定值及连锁报警系统的设定值不可随意变更，生产上确定需要改变设定值时，应做好书面记录备查。
8、自动调节系统中调节器的PID参数的*整定，需在实际试车过程中摸索，若在运转中作了某些调整应把参数值及调整日期、时间记录下来，便于以后分析比较。
9、仪表设备半成品、成品的保护措施：在施工中与土建、各专业之间存在的交叉作业现象，对仪表设备这样的易损件特别加强保护措施。
10、对于压力表、双金属温度计、热电偶等，考虑到此类仪表易损坏，因此宜于管道吹扫合格后临时试车前安装。
11、要特别注意对变送器、流量计、调节阀体仪表的保护。一是进出线口要有防雨措施，并应做好防腐蚀密封处理。二是要防止就位后现场电焊作业过电烧坏仪表内电子元件。三是安装时注意对毛细管的保护，以防毛细管拆断，硅油渗漏。
12、吊运仪表盘柜、较重仪表设备时，应避免振动、摔落及刮碰表面防腐层。不可直接在地面上拖运。
13、对于在现场就位的仪表设备，有高空坠落物危险的场所要加设临时挡板予以保护，对电焊火花的溅落部位，仪表也应相应的保护。
14、贵重、精密的仪表设备应存放在专门仓库内，设有专人保管。