1、小房间单独设置风机盘管：
（1）应确保新风直接取自室外，禁止从机房、楼道和天棚吊顶内取风；
（2）保证排风系统正常运行，以及房间经常开窗通风换气；　　
（3）没有新风系统，又不能开窗通风换气的房间，应停止使用；　　
（4）新风系统宜全天运行；
（5）确保风机盘管凝结水水盘的清洁。
2、大房间设置多台风机盘管：　
（1）确保新风直接取自室外，禁止从机房、楼道和天棚吊顶内取风，并且新风应直接送入室内各部位；　　
（2）由于房间大、进深大，应采取措施，保证内区部位的通风换气。
风机盘管的许多生产厂家为了满足室内空气清洁度的要求，还对风机盘管机组增加了空气清洁、过滤和杀菌功能。例如：机组回风箱可以双重过滤空气尘埃，而且还能吸附分解空气中的有毒物质（如致癌的甲醛等），达到*除尘、除臭、杀菌，创造室内清新空气的目的。风机盘管的出口处安装有负离子发生器的电极，可按需给室内不断补充负氧离子，产生的负离子每秒钟可杀灭数十万株病毒、病菌和尘螨等，耗电量仅4W。
上述要求意味着将来设计风机盘管系统是必须考虑新风和回风的混合问题，而以往无论是空调系统的设计还是设备制造，对其考虑和关注的程度都是不够的。例如：在现有的新风机组处理能力的先决条件下，仅仅关心冷量满足要求，而没有关心目前的风机盘管机组的结构是否能既满足冷量的要求，又满足风量和除湿量的要求，能够胜任将回风处理到所要求的状态点。