洁净室的空调净化系统运行能耗比一般舒适性空调运行能耗大得多，根据净化级别不同，洁净室空调净化能耗是一般舒适性空调能耗的1.5~15倍，其单位面积的耗电量为0.1~1.0 Kw/m²。
① 为维持洁净室所要求的温度和相对湿度，要对洁净室的送风进行必要的热、湿处理（冷却、去湿、加热、加湿 ……），就必须向空调净化系统供冷供热，供蒸汽就要消耗大量的能量。
② 为了保证洁净室的洁净度，温度、湿度等参数，必须往洁净室送入大量的空气，送风的风机和供水的水泵等动力设备也要消耗可观的能量。
③ 上述的供冷、供热、供蒸汽消耗的能量以及送风、送水设备消耗的电量随洁净级别越高，能量消耗越大。下表为不同级别洁净室的能耗统计表。
④ 洁净室的冷负荷中的主要负荷是新风冷负荷，消除工艺设备和工艺过程产热的冷负荷和抵消风机和水泵发热的冷负荷，这三项负荷占总冷负荷的90%以上；而围护结构、照明和作业人员三项冷负荷不足总冷负荷的10%。