无尘室内的气流是左右无尘室洁净度的重要因素，一般无尘室的气流速度是选0.25~0.5m/s之间，此气流速度属微风区域，易受人、机器等的动作而干扰趋于混乱、虽提高风速可抑制此一扰乱之影响而保持无尘室洁净度、但因风速的提高，将影响运转成本的增加，所以应在满足要求的洁净度水准之时，能以zui适当的风速供应，以达到适当的风速供应以达到经济性效果。另一方面欲达到无尘室洁净度之稳定效果，均一气流之保持亦为一重要因素，均一气流若无法保持，表示风速有异，特别是在壁面，气流会延着壁面发生涡流作用，此时要实现无尘室高洁净度事实上很困难。
垂直层流式方向要保持均一气流也是非常困难的，必须注重以下几点：
1、吹出面的风速不可有速度上的差异；
2、地板回风板吸入面之风速不可有速度上的差异。速度过低或过高(0.2m/s，0.7m/s)均有涡流之现象发生，而0.5m/s之速度，气流则较均一，目前一般无尘室，其风速均取在0.25~0.5m/s之间。
影响无尘室风速的因素：
影响无尘室的气流因素很多，如制程设备、人员、无尘室组装材料、照明器具等，同时对于生产设备上方气流的分流点，亦应列入考虑因素。 一般操作台或生产设备等表面的气流分流点，应设于无尘室空间与无尘室隔墙板间距2/3之处，如此可使作业人员工作时，气流可从制程区内部流向作业区，而将微尘带走；若分流点配置在制程区前方，将成为不当的气流分流，此时大部份的气流将流至制程区之后，作业员操作所引起的尘埃将被带到设备后面，工作台因而将受到污染，产品合格率也势必降低。无尘室内的工作桌等障碍物，在相接处均会有涡流现象发生，相对地在其附近之洁净度将会较差，在工作桌面钻上回风孔，将使涡流现象减少zui低；组装材料之选择是否恰当、无尘室设备布局是否完善，亦为气流是否成为涡流现象之重要因素。