车站及隧道通风空调系统的控制由控制、车站控制以及就地控制三级组成。
1)控制
（1）对全线隧道通风系统的隧道风机（包括区间隧道风机和车站隧道排风机以及中间风机房的隧道风机）、射流风机、电动风阀进行监控。
（2）对各站通风空调大系统的空调器、空调新风机、回/排风机、排烟风机、电动风阀进行监视。
2)车站控制
（1）对本站所管辖范围内的隧道通风系统的隧道风机（包括区间隧道风机和车站隧道排风机）、推力风机、射流风机、长区间隧道中间风机房的隧道风机、电动风阀。
（2）对设置在车站内的温、湿度监测点进行监视。
（3）对本站通风空调大系统的空调器、空调新风机、回/排风机、排烟风机、电动风阀、水管上电动二通阀等进行监控。对本站冷水机组、冷冻水泵、冷却水泵、冷却塔、水管上电动碟阀、水处理设备等进行监视。
（4）对本车站通风空调大系统上的防火阀进行监视（由FAS实现）；对本站通风空调大、小系统上的防火阀、防烟防火阀进行监控（监视由FAS实现）
（5）对本站通风空调小系统的空调器、空调新风机、回/排风机、排烟风机、电动风阀、电动二通阀等进行监控。
（6）对本站通风空调大系统空调器过滤器前后的压差传感器进行监视。
（7）对小系统水系统的压差传感器、流量开关等进行监视。
3)就地控制
（1）对设置在车站内的温、湿度监测点进行监视。
（2）对本站通风空调大、小系统的空调器、空调新风机、回/排风机、排烟风机、电动风阀、水管上电动二通阀等进行监控。对本站冷水机组、冷冻水泵、冷却水泵、冷却塔、水管上电动碟阀、水处理设备等进行监视。
（3）冷水机组、冷冻水泵、冷却水泵、冷却塔、水管上电动碟阀、压差旁通装置由冷水机组群控系统控制。