为保护产品不受外界污染，或为了有助于在两室间实现较高压差，可在需要严格控制压差的房间出入口设缓冲室。
1、仅为了防止缝隙渗透，所需静压差理论值极小：美国ASHRAE手册给出0.25Pa，我国学者计算出0.22Pa。美国医院标准包括手术室和隔离病房实际推荐的是2.5Pa。
通过实验得出压差和进出房间时污染泄露的关系，如下图：

可以看出，负压从0Pa增至-6Pa，泄露多减少41%，从0Pa至-30Pa，减少62%。
通过药品添加剂实验，压差和粉尘侵透的关系，如下图：

可以看出，负压从0Pa增至-6Pa，微粒传播量多减少41%，从0Pa至-30Pa，减少60%。
2、只靠室内外压差是不能杜绝污染传播的，其中原因之一是门的开启。门一开压差即消失。如下图：

3、根据理论和实验，一道缓冲室可减少污染传播近40倍，两道缓冲室可减少2000余倍。
（1）可在室门外设单侧正压缓冲室，即缓冲室对室内为负压，对室外为正压。可参考下图的设置：
这种缓冲室应有不小于6立方米的体积，具有和进入室同样的洁净度（可不高于6级，换气次数按要求洁净度确定），两边的门不要同时开启。
（2）为保护无菌生物制品不污染外界自身又不受污染，可参考下面三图设缓冲室：

   
   
这种缓冲室除应有不小于6立方米体积和双门不同时开启要求外，应有洁净送风，换气次数不应低于60次/小时。
为了实现污染区气流不外溢，半污染区以内的气流也不外流到清洁区和室外，可用下图所示的单侧正压缓冲室。

此图中室外空气可长驱直入，对产品不能保护。为改变这种倾向，可改用下图所示的在清洁区再设双侧正压缓冲。

（3）为了加强隔离，也可做两间双侧一正一负缓冲，如下图：

（4）为了既需要将产品隔离，同时又需要高的空气质量以保护产品，可用下图所示的入口处设一负一正两级缓冲室。

（5）上图有来自半污染区以内的外向气流，为消除这一现象，还应把正压缓冲室放于清洁区，如下图：

4、缓冲室有助于实现高压差
（1）按现行GMP要求，不同洁净度级别房间之间要有不小于10Pa的压差。前面介绍的国内外实验和理论研究都证明高压差并无必要，如美国关于手术室、负压隔离病房的标准，规定压差只要2.5Pa。但GMP既已规定，执行起来不仅达到难，而且能耗是很大的。
（2）在两室之间设一缓冲室，能容易实现10Pa压差，耗能又少，如下图：

如7、8级两级房间都很大，或缝隙很多，实现7级对8级10Pa正压要很大的新风量，而且不容易达到。
如果在两室之间或如上图在8级间加一个小门斗，只送风，并在至8级的门下开一百叶，则只要很少送风量即能使缓冲室对8级间达到10Pa。由于7级间与缓冲间是同级，没有压差要求，只需有很小正压差维持定向流即可。
由于缓冲室很小，又是空房间，实现7级洁净度的换气次数很小，风量很小。