全自动菌落计数仪因其使用的自动化程度高、分析结果可核对、样品信息可留存等，已逐渐被越来越多的科研院所、卫生疾控部分所喜爱，能够完成所有的菌落读数类型，自动读取平板、螺旋、涂布、倾倒等的菌落总数，是现代微生物检测实验室常用的菌落计数器。
全自动菌落计数仪采用以下功能更好地进行菌落图像处理：
1.图像增强：增强图像彩色分量，增强菌落边缘锐化；
2.菌落识别技术：菌落智能识别技术，方便设置参数；
3.平皿类型：倾注、涂布、膜滤、螺旋平皿、3M纸片，各种尺寸；
4.菌落统计速度：300个菌落<1秒；
5.区域选择统计：可选择半圆、矩形，进行任意圈定区域菌落统计；
6.人工辅助修正：删除任意区域内的误选菌落；
7.排除污染区域计数：鼠标勾勒任意污染区域，自动剔除污染区域的菌落数；
8.统计效果监视：可实时显示处理后图像，监视菌落分析的精度；
9.菌落叠加统计：自动计算叠加的菌落，模糊概率算法，增加参考数据的可靠性；
10.自动杂质剔除：根据形态、尺寸、颜色等方面的区别，进行自动杂质剔除；
11.参数自动换算：培养皿直径、样本稀释度输入，实现自动换算；
12.仪器参数设置：根据实际检测细菌种类，人工修正参数。
