奥林巴斯显微镜作为精密的光学仪器，在包装运输中的时候要注意有所讲究，如果处理不善，就会对与显微镜的目镜、物镜等等造成伤害，所以对于奥林巴斯显微镜的包装和运输，必须要有一个大的重视程度。
奥林巴斯显微镜的包装分内包装和外包装两步。内包装就是把显微镜装在特制的包装箱内。奥林巴斯显微镜在箱内应固定牢靠，保证木箱在翻倒、震动时都不会发生松动。镜头盒子也应牢靠地固定在箱内.说明书、随机附件等应带的东西均应全部包装在箱内，不得遗漏，以保证显微镜的成套性。箱内应附有清单，以便核对。最后把箱子锁好。
外包装就是运输包装。包装箱可以是厚纸箱，也可用木板箱。但不论哪种箱，均不应有裂缝、腐蚀等现象。箱子大小，应根据需要可以一台装、二台装或四台装，箱内应干燥。高、中级型金相显微镜，应以一台装为宜。特别是显微镜价格十分昂贵的产品，内包装箱的周围应有防潮纸，箱与箱之间应垫以瓦楞纸，放进外包装箱后。
外包装完成以后，箱子表面应标明精密显微镜，小心轻放，不许倒置，向上，防潮等字样标记。
在运输中：
(1)奥林巴斯显微镜在短途运愉时，应尽量把显微镜放在车辆的前部，仪器箱子下面应垫上软物，并加以固定，然后盖上蓬布。
(2)奥林巴斯显微镜在携带时，应将显微镜放在箱内正确的位置上，并固定牢靠，箱子拎在手里时不要摇晃，以防仪器在箱内受到撞击。
