1、一般工业洁净室的清扫
洁净室内环境清扫部位包括整个房间的墙面、吊顶、地面及所有物品。
对洁净室内应进行定期清扫。洁净室清扫的时间应在每天下班前工艺操作结束后进行；清扫时，洁净室洁净空调系统仍保持运行状态。当采用集中式真空吸尘系统完成洁净室的清扫工作时，要限制真空系统的排气量，以免使洁净室的正压值下降太大或形成负压。清扫用的拖布、抹布，不要用易掉纤维的织物材料，一般可用丝绸、尼龙绸等。
对于生物洁净室，吸尘器中的集尘袋和过滤器，在取出之前要用气体灭菌，取出后装入聚乙烯袋中封好，然后烧掉。
对于洁净度高的洁净室，清扫用水不得用自来水，而须采用过滤后的水；洁净室清扫用洗涤剂可按每升水加人30g中性液体洗涤剂配制而成，应选择残留物量低的中性洗涤剂。
各个洁净室应使用本室的清扫工具，清扫工具要定时清洁。清扫地板时，可用软管或湿式电气清扫机，如果有比较严重的污渍可使用清洁剂。
2、医院洁净室和手术室的清扫
医院洁净室的清扫工作应在每天下班前完成，手术室的清扫工作应在手术前后进行，以手术后的清扫为主。手术完成后，在洁净空调系统运行的状态下，打开排浊风机约15min，排除室内污浊空气，然后进行清理及清洁工作。每次清扫结束后还应继续运行洁净空调系统，直至达到规定的洁净等级，运行时间一般不应少于该系统的自净时间。每次手术后的杂物立即就地分类打包，清扫垃圾均应装入污染袋中就地密封，然后经污物传递窗或污物门运出洁净室。如果发生不可预见的非常情况，在洁净手术室内做了带污染的手术，手术后进行室内环境清扫时必须用（石碳酸）或甲醛水喷雾做全室消毒。